15-05-2020 19h00 – Les données de Santé Publique France étant téléchargeable, voici un code R qui génèrera les 2 graphes de suivi de l’épidémie disponibles plus bas en France
- les données d’hospitalisation, de réanimation, de radiés (sorties), de décès par jour,
- les variations quotidiennes de ces données.
Les données d’hospitalisation, de réanimation et de décès par jour et par région :
Le code R de l’ensemble de ce traitement :
Les graphes de type « ligne de crête » ( Ridgeline plot) montre la distribution d’une valeur numérique pour plusieurs items. Dans le cas présent, nous voyons l’importance relative des hospitalisations en fonction des régions. Le graphe de la région apparait dès que la valeur relative est supérieure à 5% de la valeur la plus élevée de toutes les régions.
Le fichier R du traitement est le suivant :
R permet également de faire des cartes choroplèthes pour représenter par exemple l’évolution départementale des nouvelles hospitalisations quotidiennes avec quatre cartes à une semaine d’intervalle chacune :
et le code R du traitement :
Les graphiques peuvent être animés comme celui de l’évolution du Covid-19 :
Ci-joint le code R correspondant :